新冠病毒是不是SARS呢?了解下冠状病毒分类
发布日期:2020-02-12 09:30:00 浏览量:1899人
前几日,在湖北省召开的第十九场疫情防控工作新闻发布会上,华中农业大学教授陈焕春介绍:“分析发现,新型冠状病毒属于sars冠状病毒”。事后陈焕春教授第一时间表示“口误”、“掉了两个字”,应为“新型冠状病毒属于sars相关冠状病毒”。
不过,不少人还是摸不着头脑:新冠肺炎与sars到底是什么关系?
首先来了解一下冠状病毒。
冠状病毒是一类具有囊膜的正链单股rna病毒,其遗传物质是所有rna病毒中最大的,也是自然界广泛存在的一大类病毒。其粒子形状并不规则,直径约60-220nm。病毒具有包膜结构,上面有三种蛋白。由于其刺突像王冠,因此被称为冠状病毒。
“冠状病毒”只是一个统称,所有符合条件的病毒都可以说是“冠状病毒”,如果严谨地从系统分类上来讲,冠状病毒属于冠状病毒科。
1975年,国际病毒命名委员会正式命名了冠状病毒科。在国际病毒分类系统上,统一采用的是目、科、亚科、属、种分类阶元。因此,冠状病毒科又分为两个亚科:letovirinae亚科和正冠状病毒亚科,而正冠状病毒亚科又下分为α、β、γ和δ四个属。
其中,α和β属涉及人类、家畜和宠物等,病毒种类较多,γ和δ属多是禽类冠状病毒,种类较少。
根据国际病毒分类委员会2018b版报告(最新版),已鉴定的人和动物冠状病毒共有23个亚属38个种。虽然有多达38种,但是其中目前已知可感染人类的冠状病毒仅6种——hcov-229e、hcov-oc43、hcov-nl63、hcov-hku1、sars-cov和mers-cov。加上这次的2019-ncov,一共是7种。
说了这么多,那sars和新冠肺炎是同一种病毒吗?如果不是,那两者究竟是什么关系呢?
首先来明确下sars在冠状病毒大家族里的定位。
sars被分类在β属,β属下分为5个亚型12种病毒,他们分别是:β冠状病毒1、黄鼠冠状病毒hku24、人冠状病毒hku1、鼠冠状病毒、普氏蹄蝠冠状病毒zhejiang2013、刺猬冠状病毒1、中东呼吸综合征类病毒(即mers)、皮皮斯特勒斯蝙蝠冠状病毒hku5、泰龙蝠hku4、卢塞图斯蝠冠状病毒gccdc1、卢塞图斯蝠冠状病毒hku9和sars样冠状病毒(即sars)。
而sars被分在β属最后一个亚型——sarbecovirus亚型下,且该亚型下仅sars一种病毒。
数据来源:国际病毒分类委员会2018b版报告
此前(1月30日),《thelancet》上发表过一篇名为genomiccharacterisationandepidemiologyof2019novelcoronavirus:implicationsforvirusoriginsandreceptorbinding的论文,文中称:系统发育分析表明,人类历史上发现的第7个感染人类的冠状病毒2019-ncov属于β冠状病毒属的sarbecovirus亚型,并在遗传学上与sars-cov不同,且2019-ncov与sars-cov在rna依赖性rna聚合酶(rdrp)基因系统发育上有着明显区别。
简而言之,新冠病毒(2019-ncov)是一种新的sarbecovirus亚属的β冠状病毒。
也就是说,2019-ncov与sars是同一亚属,意味着具有某些共同特性,但不是同一种病毒。
关于这一点,钟南山院士也在昨晚第一时间表示:新型冠状病毒是冠状病毒的一种,它跟sars冠状病毒是平行的,二者是同一类(病毒),但不是同一种。
而世界卫生组织官网上就“这一新病毒与sars一样吗?”这一问题也早已给出过明确答案:“不一样。2019-ncov与严重急性呼吸综合征病毒(sars-cov)属于同一病毒家族,但它们不是同一种病毒。”
截图来源:世界卫生组织官网
虽然ncbi(美国国家生物技术信息中心)将2019-ncov与sars分在同类,均为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒种,两者基因组序列相似度为80%左右。但从基因组序列相似性上来看,与新冠肺炎基因组序列同源性最高的也并非sars病毒。
同样是1月30日《thelancet》上的那篇论文,研究者将2019-ncov的病毒基因组与其他目前已发现的同为冠状病毒的基因组作了对比,结果表明:2019-ncov与2018年在中国东部舟山采集的两种蝙蝠源性严重急性呼吸综合征(sars)样冠状病毒bat-sl-covzc45和bat-sl-covzxc21密切相关,基因序列同源性分别达87.99%、87.23%。
《thelancet》:genomiccharacterisationandepidemiologyof2019novelcoronavirus:implicationsforvirusoriginsandreceptorbinding
相比之下,新型冠状病毒与sars和mers病毒的序列相似性仅为79%和50%。